Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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