Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms