Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TefQ9JLC6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TefQ9JLC6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms