Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hmgn5Q9JL35 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hmgn5Q9JL35 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hmgn5Q9JL35 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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