Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ldb3Q9JKS4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms