Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms