Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ybx3Q9JKB3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms