Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms