Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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