Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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