Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SelenofQ9ERR7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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