Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r46Q9EQ45 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r46Q9EQ45 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r46Q9EQ45 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r46Q9EQ45 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r46Q9EQ45 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r46Q9EQ45 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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