Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms