Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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