Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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