Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdzd9Q9D9M4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms