Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp12Q9D9M2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp12Q9D9M2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Usp12Q9D9M2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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