Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms