Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rep15Q9D7T1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rep15Q9D7T1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rep15Q9D7T1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rep15Q9D7T1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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