Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm5Q9D7I9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms