Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms