Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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