Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Snx20Q9D2Y5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx20Q9D2Y5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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