Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms