Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms