Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms