Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms