Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Shmt2Q9CZN7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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