Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms