Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Utp23Q9CX11 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Utp23Q9CX11 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Utp23Q9CX11 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Utp23Q9CX11 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Utp23Q9CX11 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Utp23Q9CX11 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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