Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RpainQ9CWY9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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