Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms