Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcf1Q9CTH6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcf1Q9CTH6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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