Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ykt6Q9CQW1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms