Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ergic3Q9CQE7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms