Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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