Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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