Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc5Q9CQA1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc5Q9CQA1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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