Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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