Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb1Q9CPU1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms