Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrbp1Q99PL5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms