Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cep41Q99NF3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms