Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms