Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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