Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms