Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pagr1aQ99L02 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms