Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfdQ925I7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms