Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms