Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms