Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd3Q91W18 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd3Q91W18 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms